ساختار MHC

MHC I و MHC II هر دو پروتئین‌های غشا گذر هستند. (روی سطح سلول اند)

ü    هر دو دارای ناحیه شیار (شکاف، cleft، groove) هستند که پپتید در آن قرار می‌گیرد.

ü    یک سری دومِین (domain) خارج سلولی دارند.

ü    یک قسمتی به نام (Trans-membrane) دارند که از غشا عبور می‌کند.

ü    یک دم سیتوپلاسمی دارند.

MHC خیلی پلی‌مورف است. واحد‌هایی که خیلی پلی‌مورف هستند داخل شیار قرار گرفته اند (یعنی همان جایی که قرار است پپتید‌های مختلف متصل شوند.). پس واحد‌های آمینواسید پلی‌مورف MHC درون یا مجاور شکاف قرار گرفته اند و سایر قسمت‌های MHC پلی‌مورف نیستند.

CD4 و CD8 به نواحی غیر پلی‌مورف MHC متصل می‌شوند.

چون CD4 و CD8 همراه TCR هستند به آن‌ها کو رسپتور (co-receptor) هم گفته می‌شود؛ یعنی یک مولکول سطحی که همراه رسپتور وجود دارد. (CD4 به MHC II و CD8 به MHC I متصل می‌شود)

T helper‌ها فقط پپتید‌های سطح MHC II و T سایتوتوکسیک هم پپتید‌هایی که توسط MHC I عرضه می‌شوند را شناسایی می‌کنند.