همه ی اجزا سیستم ایمنی (آنتی‌بادی، کمپلمان و ...) می‌توانند باعث ایجاد مشکل در بحث پیوند شوند.
HLA که همان MHC می‌باشد که در این بحث از 2 منظر به آن ها نگاه میشود:
1 HLA : از دید عفونی به آن نگاه شد. وظیفه HLA بلع آنتی‌ژن‌های داخل و خارج سلولی و عرضه آن ها به سلول‌های سیستم ایمنی و در نتیجه ایجاد واکنش دفاعی می‌باشد.
2 major histocompatibility complex (MHC): از این دید به آن‌ها نگاه شد که به عنوان عاملی هستند، که باعث می‌شوند 2 بافت با هم یکی باشند.
مشاهده شد که هر دوی آن ها یکی هستند. (MHC معمولا در علوم پایه استفاده میشود اما در بالین معمولا HLA استفاده میشود.)
تاثیر پاتولوژیک HLA ردّ پیوند است و نفش عمده و 99.99% در این مورد را دارد.
علت نقش پاتولوژیک: در افراد مختلف بشر به شدت متفاوت هست. (به دلیل پروتئینی بودن HLA است و پروتئین ها بسیار ایمونوژن هستند.)
HLA کلاس یک: در سطح تمام سلول های هسته دار بدن وجود دارد. قسمت B2-microglobulin پلی مورف نمی‌باشد و بین همه یکسان می‌باشد، اما زنجیره سه تایی (α 1, α 2, α 3) بسیار در بین افراد بشر پلی مورف می‌باشد.
HLA کلاس دو: هر دو زنجیره (α1, α2) و (β1, β2) پلی مورف هستند، اما میزان پلی مورف بودن α1 و α2 بسیار پایین می‌باشد و عمدتا در این زمینه راجع به زنجیره β1, β2 بحث میشود.
تفاوت β 2-microglobulin با زنجیره β 1, β 2 : β 2-microglobulin روی کروموزوم 17 کد میشود و همه یکسان می‌باشد، اما زنجیره B1,B2 روی کروموزوم 6 کد میشود و در همه‌ی افراد متفاوت می‌باشد.
